Stara część Flores w Gwatemali znajduje się na wyspie na jeziorze Petén Itzá, połączonej z lądem krótką groblą. W czasach prekolumbijskich Flores było miastem zwanym Nojpetén, stolicą królestwa Majów, ostatniego podbitego przez Hiszpanów. Królestwo Peten Itza wpadło w ręce hiszpańskich zdobywców 172 lata po klęsce imperium Azteków przez Hernána Cortésa w 1525 roku.
