Setki palm wzdłuż rzeki sprawiają, że Santa Gertrudis wyróżnia się na tle pustynnych krajobrazów półwyspu Kalifornijskiego. Założona przez jezuickiego misjonarza w 1751, misja Santa Gertrudis działała do 1822 roku, kiedy to została ostatecznie opuszczona. Później, gdy nowi migranci osiedlili się w tej okolicy, kościół przywrócony został do życia. Niedawno odnowiony budynek jest mniejszy od oryginalnego kompleksu. Brakuje w nim pomieszczeń gospodarczych używanych kiedyś przez Indian i misjonarzy. Kościół ma bardzo prostą konstrukcję, płaski dach, brak dekoracji, nie ma on wieży.
