Wzniesiony na półwyspie Birgu, Fort St Angelo odegrał ważną rolę w historii Malty. Przez wieki przechodził on niezliczoną ilość zmian i rozbudowy. Gdy rycerze św. Jana po raz pierwszy przybyli na Maltę w 1530 roku, osiedlił się oni w Birgu i uczynili Fort St Angelo swoją główną fortyfikacją. Fort wytrzymał napór Turków podczas Wielkiego Oblężenia Malty. W następstwie tej wojny Rycerze Świętego Jana zbudowali ufortyfikowane miasto Valletta po drugiej stronie zatoki Grand Harbour, i przeniesiono tam centrum administracyjne Zakonu.
Po wielu latach, w roku 2001, Suwerenny Zakon Maltański, doszedł do porozumienia z rządem Republiki Malty. Na jego podstawie możliwa jest znów oficjalna obecność Zakonu na wyspie. Traktat przyznaje Zakonowi ograniczoną eksterytorialność górnej części Fortu St. Angelo przez 99 lat. Zgodnie z umową, flaga narodowa Malty musi powiewać obok flagi Zakonu, a prawo maltańskie nadal obowiązuje w odniesieniu do części Fortu zajmowanej przez Zakon.
