Yakushi-ji, świątynia Yakushi Nyorai (Budda Uzdrowienia) została przeniesiona do Nary ze swego pierwotnego miejsca w roku 718. Wielokrotnie płonęła ona w ogniu, była niszczona przez wojny i siły natury. Dzisiaj tylko kilka budynków włączając pagodę wschodnią przypomina wspaniałość pierwotnej świątyni.

Trzypiętrowa Pagoda Wschodnia cudem przetrwała pożar, który zniszczył Yakushi-ji w 1528 roku. Wygląda ona na sześciopiętrową, a to z powodu pośrednich okapów zwanych mokoshi (pochylonych) dodanych do każdego piętra. Jest to bardzo rzadki element w architekturze pagody. Pagoda Zachodnia odbudowana w 1980 roku jest wierną kopią oryginału, który spłonął w 1528 roku.